参考答案

（1）A公司破产的案件应由甲市人民法院管辖。根据《企业破产法》规定，破产案件由债务人住所地人民法院管辖。法人的住所地是指法人的主要营业地或者主要办事机构所在地。
（2）A公司与B建材公司之间未审结的经济纠纷应当中止。根据《企业破产法》规定，人民法院受理破产申请后，已经开始而尚未终结的有关债务人的民事诉讼或者仲裁应当中止；在管理人接管债务人的财产后，该诉讼或者仲裁继续进行。
（3）工商银行可以参加破产程序，申报债权。根据《企业破产法》规定，连带债务人数人被裁定适用本法规定的程序的，其债权人有权就全部债权分别在各破产案件中申报债权。可知，工商银行可以参加破产程序，申报债权。破产案件中，A公司属于连带债务人，因此，债权人工商银行可以选择是否将其债权作为破产债权进行申报。
（4）①A公司可以在人民法院受理破产后申请和解。根据《企业破产法》规定，债务人可以直接向人民法院申请和解，也可以在人民法院受理破产申请后、宣告债务人破产前，向人民法院申请和解。
②债权人会议通过了和解协议。根据《企业破产法》规定，债权人会议通过和解协议的决议，由出席会议的有表决权的债权人过半数同意，并且其所代表的债权额占无财产担保债权总额的2/3以上。
③人民法院可以裁定对该和解协议不予认可。根据《企业破产法》规定，和解协议草案经债权人会议表决未获得通过，或者已经债权人会议通过的和解协议未获得人民法院认可的，人民法院应当裁定终止和解程序，并宣告债务人破产。
（5）根据《企业破产法》规定，对破产人的特定财产享有担保权的权利人，对该特定财产享有优先受偿的权利。可知，建设银行的1000万元贷款，其中800万元从抵押的财产中优先受偿，其余的200万元作为普通债权，同其他债权人一起按比例受偿。